El Programa Educativo (PE) de Ingeniero Químico (IQ), se fundó en junio de 1976, coincidiendo con el 40 aniversario de la autonomía universitaria del Instituto Tecnológico de Sonora. Se evaluó en julio del año 2000 por CIEES (Comité Interinstitucional para la Evaluación de la Educación Superior). En el 2011 fue evaluado de nuevo por CIEES y se clasificó en el Nivel I por su buena calidad. El 19 de septiembre de 2014 el PE de IQ fue acreditado por CACEI hasta el 18 de septiembre del 2019. Dentro de las sugerencias verbales que hizo el organismo acreditador fue que el programa es lo bastante maduro como para contar con al menos un posgrado.
El Instituto Tecnológico de Sonora, se ha distinguido por ser una Institución innovadora y pionera; ha creado Posgrados en Ciencias con Especialidad en Biotecnología, Ciencias en Recursos Naturales, Ciencia de la Ingeniería, etc. Es por ello, que, para fortalecer el posgrado institucional, se ha desarrollado la Maestría en Ciencias en Ingeniería Química.
El egresado de la MCIQ será capaz de resolver las problemáticas de la región y su impacto en un entorno globalizado, mediante la investigación e innovación tecnológica de procesos relacionados con nuevos materiales y fuentes de energía.
La Maestría en Ciencias en Ingeniería Química presenta dos Áreas en los cursos de Optativas: Tecnología de Materiales e Ingeniería de Procesos Avanzados.